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相對于傳統的液萃取法和蛋白沉澱法，固相萃取具有*的優勢，具體如下：
淨化方法: LLE（液液萃取）
優點: 無需特殊裝置
缺點:
1.操作繁琐，費時
2.需要耗費大量的有機溶劑，導致高成本和對環境的汙染
3.難以從水中提取高水溶性物質
淨化方法:PPT（蛋白沉澱）
優點: 操作簡單，無需特殊裝置
缺點:
1.非特異性的沉澱反應可能使微量的分析物隨着基質蛋白質共同沉澱而損失。
2.淨化效果較弱，檢測靈敏度和可靠性低。
SPE（固相萃取）
優點:
1可同時完成樣品富集與淨化，大大提高檢測靈敏度
2比液液萃取更快，更節省溶劑, 可自動化批量處理
3重現性好
缺點:
1.使用進口固相萃取小柱成本較高
2.需要專業人員協助進行方法開發
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